飛秒激光需要采用麻醉的方式。眼科手術麻醉較簡單，這種麻醉稱為表面麻醉，用眼藥水點到眼睛里，點上4-5次，然后等10-20分鐘以后手術就可以完成。 這種麻醉安全性好，而且麻醉相對較簡單，病人接受起來容易，基本上沒有痛苦，比全麻、局麻都要安全的多。目前用的麻藥相對過敏的發生率和安全性都較好，對病人不會造成大的損害。