對于決定選擇手術治療的帕金森病患者而言，還涉及到手術時間窗的問題，即什么時間選擇手術能最大限度達到最理想效果。帕金森病本身是一個慢性進行性疾病，手術時機選擇尤為重要，若能夠做到及時干預，即可為患者爭取20-30年時光。根據世界權威醫學雜志《新英格蘭雜志》發表數據顯示，提早進行手術植入腦起搏器治療帕金森病的患者，無論生活質量、運動功能，均有非常大的提高，進而極大降低藥物引起的運動并發癥。年齡和疾病病程是選擇藥物治療或手術治療的重要因素，年齡較輕的患者有更多生活質量和癥狀改善空間，并發癥更少，中軸癥狀惡化程度更緩慢。出現藥物療效下降或運動波動、異動癥時，考慮是接受腦起搏器植入的最佳時機。