絕大部分蛛網膜囊腫其實并不需要處理，可能只要觀察，甚至到成人之后不需要特別關注。對于有癥狀、有影響蛛網膜囊腫，目前主流方法是手術。手術又分為三個類型，第一個是對蛛網膜囊腫進行剝離開窗；第二種是分流，把蛛網膜囊腫當中水引到最常見腹腔等其它地方，從而達到治愈蛛網膜囊腫效果；第三種是內鏡下進行蛛網膜囊腫造瘺，是目前最主流也是最建議做的手術方式。因為是微創手術，效果會非常好，并發癥會非常少。 理論上蛛網膜囊腫進行分流有效性是100%，但是會有一系列問題，尤其是分流管依賴。一旦產生分流管依賴，有可能會產生各種情況，比如惡性顱高壓、惡性頭痛、嘔吐，這時候處理起來非常麻煩。人依賴一根管子不可靠，而蛛網膜囊腫進行造瘺，通過非常小窗口甚至只有2cm或者3cm窗口，進行內鏡下操作，損傷非常小，而且能夠避免長期并發癥，所以造瘺可作為首選。