肝膽管細胞癌一般推薦以手術為主的綜合治療，肝膽管細胞癌分為肝門部膽管癌和肝內膽管細胞癌。根據不同部位，可能切除的肝臟組織比例不同。如肝門部膽管癌的肝臟切除比例，要求相對較高，有時會做半肝切除，即50-60%的肝切除，手術較復雜，難度也較大。膽管細胞癌通常局限于某個肝段，或者肝葉，手術相對偏小。手術的目的是盡量保證達到R0切除，即腫瘤切除的邊緣無腫瘤細胞殘留。在切除后不代表治療結束，瘤切除后，建議化療，或者靶向治療。化療通常用吉西他濱，加鉑類藥物，如奧沙利鉑聯合化療。在化療過程中，注意隨訪、密切觀察，避免腫瘤復發。