生理性海水鼻腔噴霧器基本沒有明顯副作用，可以放心使用。在臨床上，無論對于鼻炎還是鼻竇炎的治療，尤其是小兒，經常會采用生理性海水鼻腔噴霧的方式，來清潔患兒的鼻腔，可以達到輔助的治療作用，對于不同類型的鼻炎、鼻竇炎都有著較好的幫助。有些患兒家長擔心長時間使用會有明顯的副作用，其實生理性海水基本與鼻腔的內環境大致相當，其濃度可以對鼻腔起到清潔、濕潤的作用，減少鼻腔內的分泌物潴留，以及減少鼻腔內炎癥因子的潴留，對鼻炎和鼻竇炎都有較好的輔助治療作用。