由于引起扁桃體化膿的病因不同，服用的藥物也有所不同，常見于以下幾種情況：1、細菌感染：以球菌為主，患者對青霉素、頭孢不過敏的情況下，可以口服阿莫西林、頭孢唑林、頭孢拉定、頭孢呋辛或頭孢克肟等，以緩解扁桃體化膿的癥狀；2、病毒感染：此類患者可以口服利巴韋林或抗病毒口服液等，同時配合感冒清熱顆粒、清熱解毒口服液以及雙黃連等傳統中藥進行治療，上述藥物應在醫生指導下服用。對于全身癥狀，除針對性用藥外，患者在日常生活中應注意休息并增加飲水量，有利于疾病的恢復。