甲溝炎是指甲旁邊的軟組織發生的炎癥，多半就是有細菌感染，會產生疼痛，甚至化膿這樣一種情況。而灰指甲主要是指甲的霉菌感染，可能不產生疼痛，但是指甲可能會變黑、變灰，甚至粗糙，甚至松散等這樣一些情況。1、發生的部位：灰指甲是發生在指甲，甲溝炎是發生在指甲的旁邊，軟組織，就是部位不一樣；2、感染的細菌：引起甲溝炎和灰指甲的感染的細菌也不一樣，甲溝炎多半都是細菌感染，而灰指甲是霉菌的感染；3、治療：在治療上當然也完全不同，甲溝炎主要是要抗炎治療，或者是切開排膿，把膿液排出去，主要通過抗菌治療，都可以得到恢復。而灰指甲，需要涂抹抗霉菌的藥，有可能治療起來比較困難，時間特別長。