核磁共振為影像學檢查，對于身體無較大損傷。若不是特定性觀察盆腔及子宮內膜，排除其疾病，月經期可以做核磁共振檢查且對身體健康無任何影響。建議盡量不要在月經量較大的時候觀察盆腔及子宮內膜，活動性出血可能對核磁共振的結果產生部分干擾，但此類情況并不絕對。若宮腔內無金屬環、身體內無金屬物質，月經期間可以做核磁共振檢查，尤其部分患者可能只做頭部、上腹部或者其他軟組織的檢查。