慢性扁桃體炎的治療主要分為藥物治療和手術治療，根據慢性扁桃體炎的癥狀劃分，可分為慢性扁桃體炎反復感染，以及慢性扁桃體炎本身癥狀。1、慢性扁桃體炎反復感染：當慢性扁桃體炎反復急性感染的時候，病人可能會出現發熱、咽痛、咽干、咽撕裂樣的感覺，這時候要給予抗生素的口服，像頭孢或者阿奇霉素類的藥物，局部給予含片、漱口水，以及治療慢性扁桃體的中成藥進行口服；2、慢性扁桃體炎本身癥狀：當慢性扁桃體炎本身出現的癥狀，比如咽部的異物感、咽痛。有些病人扁桃體發炎，導致食物殘渣、細菌和脫落上皮形成豆渣樣的改變時，病人會有口臭，還有膿酸。病人將膿酸咽下會有胃腸道的刺激癥狀，出現乏力這些情況。有些慢性扁桃體病人出現打鼾，也可以給予含片、漱口水以及咽喉炎的中成藥治療，但是如果這些癥狀，在藥物治療效果不好，病人反復出現急性的感染，一年出現3-5次，連續2年以上，就要進行手術切除治療。