乙型肝炎病毒表面抗原是乙肝病毒外殼的組成成分，乙肝病毒表面抗原陽性說明有乙肝病毒感染，陰性說明沒有乙肝病毒感染。從來沒有得過乙型肝炎時，乙肝五項全陰性，乙肝病毒表面抗原也會是陰性，說明沒有感染乙肝病毒。這樣的人群需要注射乙肝疫苗，因為乙肝病毒表面抗體也是陰性，對乙肝病毒沒有免疫力。對于經過有效的抗病毒治療的慢乙肝患者，乙肝病毒表面抗原轉陰，或者乙肝病毒表面抗原轉陰以后表面抗體轉陽，是抗病毒治療得到的最好效果。在臨床上，乙肝病毒表面抗原的陰轉后，患者的肝功能也就恢復正常，而且處于穩定狀態，乙肝病毒的DNA也檢測不到，稱為臨床治愈，即便停抗病毒的藥，這種狀態也會持續存在。對于表面抗原陰性的慢乙肝患者，肝組織中仍然有少量cccDNA，如果患者的免疫力下降，或者使用免疫抑制劑，從而導致免疫力下降。在肝細胞中的少量病毒就會活躍復制，會導致肝細胞再損傷，而且患者仍然有發生肝硬化，甚至肝癌的機會，所以對患者要定期復查。