肛門檢查較短，僅能觀察直腸下段一部分，無法檢查腸子。 肛門檢查一般包括肛門外觀、肛門指診和肛門鏡。肛門外觀主要看肛門周圍皮膚或肛門周圍有無病變，包括顏色、腫物、分泌物等。肛門指診是通過用手指插入肛門，感覺直腸下段有無異常，通過肛門鏡可觀察直腸下段有無異常表現。一般人手指長7cm，肛門鏡一般為5-7cm，大腸為1.5m，包括直腸，乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸和盲腸，所以肛門檢查無法查大腸或腸子。