在醫學上子宮內膜異位囊腫，通常被百姓稱為巧克力囊腫。實際上是在位子宮內膜，即在宮腔里的子宮內膜異位的一種表現形式，即子宮內膜因不明原因異常移位到卵巢上。這種異位的子宮內膜仍然具有活性，并且在卵巢的周期性排卵和激素波動的刺激下，會發生周期性剝脫出血。由于沒有流出的腔隙，無法像子宮內膜那樣通過宮頸和陰道排出，即月經血，而是在卵巢內形成囊腫。隨著時間的推移，囊腫會增長，并且血液中的水分會被慢慢吸收，從而使囊腔內的液體變得黏稠，并且顏色加深，由于鐵元素的析出，甚至變成褐色、黃褐色或黑褐色，類似巧克力。因此，被稱為巧克力囊腫，實際上是一種卵巢行的子宮內膜異位癥。實際上是卵巢型子宮內膜異位癥的一種良性疾病，有時候囊腫也可能惡變。隨著囊腫的增大和不規則破裂的出現，一部分陳舊血液會流入盆腔，伴隨子宮內膜細胞的脫落，從而可能導致盆腔子宮內膜異位癥。從長遠來看，可能導致卵巢、輸卵管和盆腔嚴重的粘連，并引起性交痛和不孕癥。在個別情況下，子宮內膜異位囊腫也可能惡變。因此，如果女性出現子宮內膜異位囊腫的癥狀，應及時就醫并進行定期檢查，必要時進行手術治療。