沒有食物可以完全消除幽門螺桿菌，目前幽門螺桿菌需要藥物根除，通常需服用質子泵抑制劑(PPI)加2種抗生素，再加鉍劑，共服用14天，是目前主要用于根除幽門螺桿菌的治療方法。當根除幽門螺桿菌期間PPI類藥物需空腹時服用，抗生素應餐后服用，可以減少消化道癥狀。鉍劑通常需要飯前0.5小時服用，可以提高根除率，減輕消化道反應。患者在根除幽門螺桿菌期間，飲食方面應注意避免進食過酸食物，酸性環境不利于幽門螺桿菌根除。食物雖不能徹底消除幽門螺桿菌，但除以上藥物外，益生菌可以提高幽門螺桿菌根除率，甚至有些益生菌可以用來殺除幽門螺桿菌，目前這類益生菌在臨床也有一部分使用，但相對于四聯藥物來講根除率較低。