拉肚子即腹瀉，腹瀉時吃奧美拉唑膠囊沒有任何作用。多數腹瀉病因是病毒或細菌感染，引起腸道炎癥，腸道排空異常，包括腸道分泌增多。但奧美拉唑膠囊主要是用于抑制胃酸的分泌，可以治療反酸和燒心的癥狀。所以，奧美拉唑對于腹瀉沒有治療作用。但部分腹瀉急性胃腸炎患者會合并有惡心、嘔吐的癥狀，大量含有胃酸的食物就會經食道嘔吐到患者體外。在這個過程中，部分患者反酸燒心的上消化道癥狀非常重時，醫生會處方奧美拉唑，其目的主要是減輕胃酸對食管的腐蝕，以及反酸和燒心的癥狀，但并不是用來治療腹瀉的。如果患者僅出現腹瀉情況，醫生一般不會處方奧美拉唑。通常會查血常規，來判斷腹瀉是由細菌感染，還是病毒感染引起的，然后根據病因給予不同的治療。