如果扁桃體發炎引起咳嗽很厲害，多是由扁桃體的細菌感染所引起，常見治療藥物主要包括以下幾種：一、抗生素：1、青霉素類藥物：比如阿莫西林、阿莫西林克拉維酸鉀等；2、頭孢類藥物：如一代頭孢、二代頭孢，二代頭孢在此方面優于一代頭孢，二代頭孢常見的有頭孢克洛、頭孢丙烯等；2、喹諾酮類藥物：主要有氧氟沙星、左氧氟沙星，或者是拜復樂的片劑，但是喹諾酮類抗生素，但要注意要在18歲以上進行應用，而且是非孕期、非產期、非哺乳期。二、利咽止咳藥物：1、中成藥：可以用清熱解毒、止咳的中成藥，比如蒲地藍口服液、藍芩口服液、三黃片、牛黃解毒片、蘇黃止咳膠囊，甚至類似于阿片類的鎮咳藥，在咳嗽較為劇烈的時候，可以進行選擇性應用；2、漱口水：可以起到較好的幫助作用，可以用淡鹽水、康復新液進行漱口；3、含片：有研究表明，血糖正常的人群出現上述不適時如果應用含片，也可以起到清咽、利咽，緩解干燥、咳嗽的作用，比如金嗓子喉寶、西瓜霜含片、西吡氯銨含片、咽炎含片、鐵笛片等。