導致5個月寶寶頻繁搖頭的原因可能包括以下幾方面：1、維生素D缺乏：5個月寶寶生長發育較快，對于維生素D需求量較大，維生素D能夠促進鈣吸收和利用，如果出現缺鈣，會出現搖頭、多汗、睡眠不安等情況，及時補充維生素D和鈣劑即可；2、濕疹：寶寶皮膚嬌嫩，如果在面部、頸部、前胸等部位出現濕疹，可能導致寶寶自覺不適，進而出現搖頭的癥狀，如果同時存在乳糖不耐受或牛奶蛋白過敏等情況，可能會加重濕疹，家長需要重視并及時給予治療；3、外耳道炎：寶寶外耳道較為狹窄，外耳耵聹分泌旺盛，以至于較容易形成耵聹栓塞，引起外耳道炎。如果寶寶感覺外耳道不適，可能會劇烈搖頭，家長需要注意耳部護理，必要時到耳鼻喉科進行診斷、治療；4、神經發育：可能與該年齡段的神經發育有關，部分屬于正常的生理現象，但也需要注意疾病影響導致的搖頭，如癲癇等疾病，需要盡早發現、盡早治療。