根管治療的過程當中，如果有器械有穿通透刺到肉的情況，一般在治療結束之后，刺到肉的部位會有一定的創傷、滲出、不舒服，以及治療后的疼痛。通常分為兩種情況，如果是穿通刺到肉，從正常的根尖孔或者是側支根管，器械穿通出去刺到肉。將來如果有輕微的刺激后的反應，容易順著根管進行引流出來，問題不大。但是還有另外一種情況，屬于不正常的表現。從根尖孔或者側支根管穿出去刺到肉，而是在根管預備的過程當中，器械發生了側穿，即根管的半路刺穿。刺穿之后，在根管治療的過程當中，器械就容易從側穿的部位穿出去刺到肉。這種情況下，側穿的部位可能形成炎性的病灶，而炎性的病灶有時在側方，則不好引流出來。這種情況發生側穿之后，將來可能導致根管治療的失敗。如果是根管預備過程當中發生根管壁的側穿，此時造成了刺到肉。如果是引起慢性炎癥，可能不容易消退，還容易導致根管治療的失敗。如果是根管治療過程當中，正常從根尖孔穿出或者從側支根管穿出，刺激經過一段時間的恢復，應該問題不大。