奧硝唑和甲硝唑是同一類藥物，其中奧硝唑是新一代的藥物，在用藥方式上會有一些進步，相對于甲硝唑比較明顯的副作用，比如惡心、嘔吐會少一些。所以對于奧硝唑，尤其是輸液用的奧硝唑，比甲硝唑的副作用要稍微輕一點。而奧硝唑和甲硝唑針對厭氧菌或滴蟲感染，都有比較好的治療效果。甲硝唑效果也非常好，但是特別苦，惡心、嘔吐的副作用相對大一些，而奧硝唑的副作用會相對少一些，所以口服用藥考慮甲硝唑，靜脈給藥考慮奧硝唑。但奧硝唑并不是沒有副作用，服用奧硝唑也可能會有惡心、嘔吐的表現，只是可能相對比甲硝唑要稍微好一些，副作用小一些。