女性腰兩側疼痛的原因較多，具體如下：1、泌尿系統的疾病：此時需要考慮女性泌尿系統是否出現了問題，若女性有腎炎、腎積水、腎結石、輸尿管結石、膀胱炎、膀胱結石、尿路感染等泌尿系統疾病，就會造成女性腰兩側疼痛；2、婦科以及盆腔相關的疾病：女性腰兩側疼痛時也需要考慮是否是婦科以及盆腔相關的疾病，比如慢性盆腔炎、附件炎、卵巢囊腫等問題；3、消化系統疾病：此時也需要考慮腹部的臟器，比如女性是否有消化道疾病，如有些腸炎、胃炎的女性也會出現腰兩側疼痛；4、脊柱的疾病：若女性的腹腔臟器、泌尿系統、婦科等都沒問題，就需要檢查一下是否是脊柱出現了問題，如是否有腰椎間盤突出、腰椎小關節錯位，上述疾病可卡壓腰后部的后支神經；也要注意是否有慢性的腰肌勞損。總之，腰椎間盤突出、椎體滑脫、小關節錯位、腰肌勞損也會造成女性腰兩側疼痛。