孩子的骨齡小于實際年齡的原因如下：1、遺傳因素：如孩子的父母在小的時候就屬于晚發育的情況，身高比同齡孩子矮，而且身高快速增長的年齡段比別的孩子發育延遲，這時孩子可能骨齡也要落后，主要由于遺傳因素造成；2、營養狀態異常：如孩子在日常生活當中存在厭食、挑食、偏食導致營養不良，這時會影響身高、體重的增長，導致骨齡比同齡的孩子落后。這種情況下要積極改善飲食結構，設定科學、合理的飲食結構。當營養狀態提高后骨齡會逐漸達到同齡孩子的水平；3、疾病：常見內分泌系統疾病，如甲狀腺功能減低或者垂體、下丘腦存在異常，引起生長激素分泌缺乏，都可以導致骨齡落后的現象。