小便時尿道口不舒服有點疼痛的原因要區分對待，男性和女性的原因不同： 1、女性最常見的原因是泌尿系統的感染，如尿路感染，即膀胱尿道炎，因為女性的尿道比較短，離陰道口和肛門都比較近，很容易導致細菌的感染，此時會出現病人排尿時會覺得尿疼，主要表現為尿道疼痛或尿道口的疼痛； 2、男性尿道比較長，一般男性的尿道不容易出現感染，但是男性的陰莖外面特殊的結構叫做包皮，包皮會蓋著龜頭，也會蓋著尿道外口，如果包皮長時間的蓋著龜頭和尿道外口，其里面也會滋生細菌，有的病人不僅排尿時尿道口疼，還會出現龜頭的紅腫，即包皮龜頭炎。對于該情況，通常建議病人翻開包皮看看，如果龜頭里面很紅，有些紅點或者有些白色的分泌物，即包皮頭炎，也會導致尿道外口的疼痛。因此排尿時尿道外口疼，最常見的原因包括泌尿系統感染，即膀胱尿道炎和男性的包皮龜頭炎。