在臨床上，需根據不同原因決定牙齦腫痛是否需要吃藥，臨床上較常見的引起牙齦腫痛原因為牙周炎或急性牙齦炎。在急性期可口服一定抗生素藥物，如二代頭孢，頭孢丙烯，聯合硝唑類藥物如甲硝唑、奧硝唑，對炎癥性疾病通常可起到較好的治療效果。必要時可在醫生指導下合理使用止疼性藥物，在急性期得到控制之后為病人做標準的牙周治療，便可以從根本上緩解牙齦腫痛。牙體類疾病在臨床上也會表現出牙齦腫痛癥狀，必須在專科醫生指導下做牙體治療，便可以緩解疼痛，此時不需要服用抗生素。此外，也有牙齦腫痛是發生在頜骨內的囊腫類或腫瘤類疾病，以及發生在牙齦上的腫瘤性疾病引起局部感染，導致牙齦腫痛。因此出現牙齦腫痛，不能單純自己口服各種藥物，應在醫生指導下合理使用藥物。必要時做專科檢查進行診斷和鑒別，以免部分疾病誤診。