肝癌晚期能否進行穿刺，主要取決于穿刺的目的和患者的體質情況。晚期肝癌患者，如身體狀況較差，嚴重營養不良，凝血功能較差，則穿刺的風險較大，或腫瘤體積巨大，穿刺可能會引起，腫瘤的破裂出血，腹腔轉移或其他風險，因此一般不建議進行穿刺。其次是穿刺的目的也非常重要，如臨床上通過血清學，和影像學診斷已明確為肝癌，則沒必要進行穿刺，進行病理學診斷。如穿刺取得標本，進行組織學或基因檢測，來評估放療、化療、靶向、免疫藥物治療是否有效，協助臨床制定治療方案，則可以對病人進行穿刺。其次如腫瘤體積較大，或位置靠近膽管壓迫膽管，引起了病人的黃疸，則可考慮進行穿刺，經皮肝穿刺膽管引流，以引流膽汁消除黃疸，并且為藥物治療創造條件。