嬰兒可以使用苯巴比妥鈉，并且在此時期應用較廣泛，常用于催眠、鎮靜、抗驚厥及抗癲癇。若嬰兒需進行CT檢查或核磁檢查，但由于嬰兒年齡較小，可能會大哭大鬧導致無法檢查，此時需使用鎮靜劑，即苯巴比妥鈉。嬰兒出現驚厥的情況也較為常見，在呼吸道疾病高發的季節，兒科會頻繁出現由于驚厥而就診的嬰兒，此時在臨床上也會經常應用苯巴比妥鈉抗驚厥、鎮靜等。對于癲癇的嬰兒，也可能會長期使用苯巴比妥鈉。并且由于苯巴比妥鈉是肝酶的誘導劑，能夠促進肝臟酶活性，促進膽紅素的轉化，所以在新生兒黃疸時也會適量使用苯巴比妥鈉進行治療。