在臨床上發現大部分囊腫都是良性的，不會癌變，出現這種惡性的幾率只有千分之幾，所以不用過于擔心。一般肝臟出現囊腫，最常見的是一種單純性囊腫，往往這種單純性囊腫是良性疾病，而且大部分情況下不會惡變。如果只是單純出現肝臟上小的囊腫，尤其是單發的小囊腫，壁又較薄，臨床上基本上就不會考慮其癌變，不會考慮其是惡性，而且這種囊腫較難產生癌變。 但是對于有些囊性疾病，比如囊腺瘤，有一定癌變的機會。囊腺瘤和普通單純性囊腫的區別主要是囊腺瘤相對是多房性或者多囊性，囊中有分隔，而且這些分隔相對壁較厚。在做檢查、增強檢查時會發現，這些囊壁有強化，而且有個別時候，囊壁上還有凸凹不平，甚至有結節。在這種情況下，癌變的幾率就較大。所以對于肝上囊腫，首先要排除囊腺瘤，或者囊腺癌。