顯微根管治療術的前提是全程在顯微鏡下進行操作。整個操作流程和傳統的根管治療術差別不大，包括根管的進入、根管感染物質的清理、根管空腔的嚴密充填，以及后續牙冠的修復，同時還包括補牙、冠的修復等，是一個整體的過程，和傳統的根管治療差別不大，只是需全程在顯微鏡下進行操作。以醫生的經驗來講，患者要相信醫生，全程應該放松，不要緊張，因為術中疼痛，包括牙科治療中間患者感受到的疼痛，有多半是因為緊張造成的，所以需要放松，需要信任醫生，因為整個顯微根管治療過程已反復強調，是在微創的環境下進行，所以產生的疼痛是無痛或者是非常微小的疼痛，患者要放松不要緊張。在這個前提之下，整個治療過程是在比較舒適的、輕松的環境下進行。即整個過程是比較輕松和愉快的。