膽囊結石去除膽囊后對身體的影響很小，但不同機體可能存在差異。部分患者膽囊切除后可能導致膽汁反流性胃炎。理論上講，膽囊屬于司令部，管理整個膽道的壓力，膽囊切除后，導致Oddi括約肌功能障礙，壓力調節功能障礙，膽汁逆行到胃，引起膽汁反流性胃炎。 膽囊的功能是儲存膽汁，攝入脂餐后膽汁可起到脂肪乳化的作用，如果膽囊被切除，無法及時發揮上述功能，代償機制也尚未形成，可能出現一過性脂肪瀉，即進食油膩食物后腹瀉。但通常上述情況，可短期內通過人體代償。