女生上廁所時小便的部位有疼痛，可能是尿道炎、膀胱炎、尿道口發炎等所致，具體治療方法如下：1、一般治療：建議及時多喝水、多排尿，用清水將會陰部清洗干凈；2、藥物治療：還要及時化驗尿常規，觀察尿中紅細胞、白細胞的情況，如果尿中白細胞明顯增多，通常提示有感染，需要早期使用廣譜抗菌素進行治療，最常見的有頭孢菌素類、喹諾酮類、大環內酯類藥物。喹諾酮類藥物有左氧氟沙星、環丙沙星等，大環內酯類藥物有阿奇霉素、羅紅霉素、米諾環素等，頭孢菌素類藥物有頭孢地尼、頭孢克洛等，一般治療3-5天，癥狀都會明顯緩解。因為女性尿道比較短、比較直，女性有月經期、性生活或者平時不愛喝水，這些因素都會導致女性特別容易出現泌尿道感染，感染后就會有小便部位疼痛、排尿燒灼感等。