底節區是腦部中央有灰質合團結構的總稱，包括在內囊附近，殼核、蒼白球、外囊等相關結構。如果發生雙側對稱性病變，通常可以出現很多情況。因為這個位置對中毒、缺氧非常敏感，所以酒精中毒、一氧化碳中毒等都會出現相應病變。另外，出現代謝性腦病如血糖過高，或者嚴重低血糖以及線粒體腦疾病，也容易出現底節區病變。肝性腦病也可出現類似表現，所以該區域對于代謝性物質改變十分敏感。另外對于血管性疾病而言，由于丘腦供血可以是單側支配雙側，變異較多，也可出現雙側病變，如腦血管病中的基底動脈尖綜合征。