如果一旦確診為壞死性小腸結腸炎，患者不可以在院外進行治療，而應該選擇住院治療。按照壞死性小腸結腸炎的嚴重程度，臨床上將其劃分為三類六級，即ⅠA級、ⅠB級、ⅡA級、ⅡB級、ⅢA級、ⅢB級。針對嚴重程度不同的患者，臨床上選擇的治療方法亦不相同。比如ⅠA級壞死性小腸結腸炎患兒的病情最輕，可以表現為輕微腹脹，其腸鳴音較弱，臨床上可以對此類患兒禁食3日，并且應用抗生素3-5日，同時應動態觀察患兒的腹脹情況。如果ⅠA級壞死性小腸結腸炎進一步發展至IB級，甚至Ⅱ級、Ⅲ級，必要的時候可能需要進行手術治療。如果一旦發現壞死性小腸結腸炎患者伴有穿孔，即通過X光片可以觀察到患兒的膈下有游離氣體，并且其腸管明顯的擴張，這種情況下患兒必須要選擇外科手術進行治療。