脊柱關節炎通常有一定家族聚集史，即患者家屬有過脊柱關節炎，無論是血清陽性還是陰性脊柱關節炎，下一代發生脊柱關節風險均會較大程度增加，所以血清陰性脊柱關節炎存在一定遺傳傾向。脊柱關節炎患者會檢測HLA-B27基因，若為陽性，通常稱為血清陽性脊柱關節炎，發生遺傳概率相對較高。部分脊柱關節炎患者查血時基因檢測指標為陰性，則發生家族遺傳史概率會下降，但并不是沒有遺傳傾向。對于脊柱關節炎患者而言，沒有絕對遺傳傾向。即在臨床上部分患者患脊柱關節炎，但家族并沒有此類病史，或較多患者下一代沒有表現出此病，也沒有出現血清陰性脊柱關節炎相關癥狀。所以，脊柱關節炎發病機制與遺傳影響較不清晰。