結膜炎眼藥水的停用時間，一般需要根據患者結膜內的炎癥程度進行決定，如慢性結膜炎，一般需要用2周甚至3周，急性結膜炎一般用2周左右，基本可以恢復。用藥期間應該注意用藥頻次，保持患者結膜囊內藥物濃度，以此較快的控制炎癥的發生。除此之外，還有一種過敏性結膜炎，過敏性結膜炎由于過敏原沒有完全去除，會反復發作，停藥時間需要根據患者個人癥狀決定，可能用藥時間會較久，因此結膜炎在用藥期間，需要根據炎癥的情況，如急性或慢性、細菌性或過敏性，根據情況應用藥物后，結膜炎通常都可以控制。