對于帕金森的手術時機隨認知不斷變化。初期藥物治療無效后再進行手術治療，后期研究發現如藥物治療無效，出現較重并發癥時手術效果較差。目前研究成果認為對于早期、中期病人，可使用腦起搏器進行治療，效果較好，通常病情中期即可考慮進行手術治療。 建議一旦病人用藥后療效波動，或用藥后出現較重藥物副作用，如異動癥、凍結癥狀時，即可進行手術治療。部分患者可能病程發展比較慢，用藥8-9年才開始出現藥物控制較差，有些患者可能3-4年即可出現，所以很難從年限來判斷。 通常可以根據藥物控制時間、整個生活質量、病人年齡等進行判斷，患者年齡越小，手術效果越安全，療效越好。