先天性心臟病引起缺氧常見原因如下：1、部分靜脈血沒有經過肺循環氧合的過程，直接通過先天性心臟病的異常通道，從右側心臟直接進入左側心臟，即靜脈血沒有在肺中得到充分的氧合便進入動脈，在給心、腦、腎、肌肉、胃腸區供血時，血中的含氧量較低而引起缺氧；2、如肺動脈瓣狹窄、肺動脈梗阻的病人，血液難以從右心進入到肺循環中，阻力相對較高，使靜脈血難以得到快速、充分地氧合，導致比較明顯的心力衰竭。還有部分先天性心臟病可能是發生在左側心臟，比如主動脈瓣異常、二尖瓣異常，瓣膜長期的改變導致左心衰竭，導致肺中淤血，也會引起缺血、缺氧。