瘧疾的治療，目前在臨床上首選的藥物應該是青蒿素類，對于瘧原蟲效果比較好，而且不良反應較少。在臨床當中使用最多見的藥物，比如青蒿琥酯、蒿甲醚，可以靜脈注射和肌肉注射。另外可以選擇磷酸萘酚喹、雙氫青蒿素哌喹、磷酸咯萘啶等，進行口服治療，相對的不良反應也比較少。如果出國還可以選擇二鹽酸奎寧、硫酸奎寧，或者這些奎類藥物進行抗瘧治療。除了抗瘧治療以外，還要加用器官功能保護的藥物，從而形成綜合抗瘧治療的方法。世界衛生組織推薦，在整個的全球范圍內針對瘧疾，應當使用以青蒿素為基礎的綜合治療方法。因此，如果大家出國旅行，特別是前往瘧疾的流行地域，比如非洲的撒哈拉以南、拉丁美洲地區、東南亞地區，都需要攜帶抗瘧藥物。在短暫的時間內可以口服這些藥物作為預防，在長期情況下，一旦確診瘧疾，能夠快速有效的進行治療，避免使得瘧疾對每位患者產生嚴重的損害。