大多數的甲減患者應該終身使用藥物進行替代治療，即大多數甲減的患者可能需要永久吃藥。因為甲狀腺功能不可再生，一旦甲狀腺遭到了手術、免疫等因素損傷后，甲狀腺炎自身沒有修復功能，所以血中的T?、T?水平會越來越低，此時就需要額外補充甲狀腺激素，如左甲狀腺素鈉。此外，需要注意亞急性甲狀腺炎。亞急性甲狀腺炎屬于特殊情況，有些患者可能在亞急性甲狀腺炎的整個疾病過程中，會出現一過性甲減，所以有些患者的甲狀腺功能可以恢復。總之，大多數甲減患者的甲狀腺功能一般都不可恢復，所以甲減的患者一般應該永久使用藥物替代治療。但隨著季節不同、患者的狀態不同，隨時可能需要調整藥物劑量，因為不同情況下甲減患者對藥物的需求也有所不同。雖然大多數甲減患者都需要終身吃藥，但藥量可以隨時調。但若患者開始吃的藥物的量特別小，可能會出現一過性停藥，但還是希望患者長期隨診，因為有些患者可能后期還是繼續要吃藥。