頭內部隱隱作痛，要盡快去醫院做相關檢查，通過頭顱CT、核磁共振、腦電圖明確診斷，根據不同病因采取不同措施，具體如下：一、器質性疾病：包括腦積水、腦炎、腦梗、腦出血、腦腫瘤，根據相應結果，進行對因治療；二、原發性疾病：1、神經性頭痛：主要是緊張性頭痛，熬夜、疲勞、電視、電腦、手機使用過多、精神壓力大、情緒波動都會引起頭痛。需要放松精神，給予放松肌肉的藥物改善癥狀；2、偏頭痛：熬夜、疲勞、女性生理期、情緒波動造成偏頭痛發作，也會出現頭部隱痛、跳痛；3、叢集性頭痛：部分患者是因為叢集性頭痛發作，特別是過度疲勞會誘發，出現眼眶周圍隱痛；4、其它病因：勞累、疲勞、免疫力下降引起病毒感染，造成神經炎、神經痛，也會表現為刺痛。需要給予神經痛藥物改善癥狀，如加巴噴丁、普瑞巴林。