食管黏膜病的治療具體還要根據食管黏膜的病變類型決定，如下所示：1、內科治療：如果是炎性相關病變，可能只需內科治療，如反流性食管炎，與酸過多的反流所造成的食管黏膜損傷有關。這時可能會選擇抑制酸分泌的藥物，如雷貝拉唑、泮托拉唑、奧美拉唑，再輔以黏膜保護劑，如鋁碳酸鎂咀嚼片、鋁鎂加混懸液等聯合治療，可以促進黏膜愈合；2、內鏡下切除：如果食管黏膜病變是早期腫瘤，如早期食管癌，僅累及黏膜層，為食管原位癌，可以進行內鏡下切除，即內鏡黏膜下剝離技術、ESD技術，將整個食管病變的黏膜完整剝離，然后進一步送檢。對于一些食管黏膜明顯的狹窄，還可以進行狹窄黏膜的切開治療，在內鏡下也可完成。