腦囊腫不會自行消失，囊腫非腫瘤，為先天性疾病，多數囊腫不引發任何癥狀，長時間靜止，不似腫瘤不斷生長。囊腫患者應行臨床觀察，如每隔1-2年進行頭部影像學檢查，觀察過程中囊腫如明顯增大，出現頭疼、頭暈、惡心、嘔吐、視神經乳頭水腫等顱內壓增高癥狀，甚至肢體無力、癲癇、失語等癥狀，應積極處置，如行囊腫切除術、囊腫內分流術、囊腫腹腔分流術，如行恰當處理，囊腫預后效果較好。