根治幽門螺桿菌的用藥，主要是四聯治療、兩周方案，可使用的藥物如下：1、質子泵抑制劑：奧美拉唑、雷貝拉唑、艾普拉唑、泮托拉唑等，一般對于初治的病人，選擇哪一種藥物都可以。但是如果對于曾經治療過，且治療失敗的病人，可能會更加推薦使用雷貝拉唑類藥物；2、鉍劑：臨床上用得比較多的有復合的含鉀的鉍劑，如復方鋁酸鉍顆粒以及膠體果膠鉍制劑；3、抗生素：需要從阿莫西林、左氧氟沙星、克拉霉素、甲硝唑、替硝唑、米諾環素、呋喃唑酮等抗生素中，選擇兩種抗生素，然后與選擇的質子泵抑制劑、鉍劑組成經典的四聯、兩周殺滅幽門螺桿菌的方案。對于抗生素的選擇，一般如果病人沒有青霉素過敏史，首選阿莫西林，在此前提下，會搭配如米諾環素、克拉霉素組成四聯的根治幽門螺桿菌的方案。此種方案總的有效率，對于大部分病人能達到90%以上。如果對青霉素過敏，可以用左氧氟沙星代替阿莫西林，也能夠達到比較好的療效。對于特殊病人，即如果反反復復治療幽門螺桿菌效果不好，需要做胃鏡。在胃鏡下取病理以后，在體外做耐藥試驗，篩查病人適合用什么樣的藥物。然后在藥敏試驗的指導下，進行殺幽門螺桿菌治療，就能夠達到根治幽門螺桿菌的目的。