通常掛消化內科的普通號、專科號、專家號都會常規開具胃腸鏡檢查單，但普外科全科有所需求，患者做胃腸鏡時醫生會開具胃腸鏡申請單。如果患者不太清楚是否需要做胃腸鏡，需先到消化內科就診，醫生會根據患者主訴、家族史各方面了解，決定是否有必要近期進行胃腸鏡檢查。胃腸鏡檢查需要注意的事項需詢問消化內科醫生，掛消化內科得到的準確答復較多。全科醫生及普外科醫生考慮角度不同，全科醫生多數基于篩查流行病學及全國普查，而普外科醫生多數考慮有沒有長消化道腫瘤，才會考慮要做胃腸鏡術前檢查。