胃鏡和腸鏡都存在些許不適感，但大部分患者都能耐受，具體如下：1、胃鏡檢查：普通的胃鏡檢查，會采用咽部局部的麻醉，不會覺得疼，但可能會有惡心的感覺，主要是因為胃鏡通過咽部，產生了咽反射；2、腸鏡檢查：做腸鏡檢查時，需要向腸腔內注氣，使腸腔展開，以便更好地觀察病變，因此可能會覺得腹部脹氣，但在做完腸鏡檢查后，會把腸腔內多余的氣體吸走，大部分患者不會感覺到明顯的腹脹。同時在檢查期間，腸鏡在腸道內可能會拐彎，出現牽扯痛。目前無痛的胃腸鏡發展得非常成熟，是指在靜脈麻醉下做胃腸鏡檢查，靜脈輸入像丙泊酚之類的鎮靜助眠藥物，可以在無痛的狀態下完成胃腸鏡檢查。