咳嗽有痰的治療主要包括病因治療以及對癥治療。如果患者出現發熱、膿性痰或重癥咳嗽，需要應用抗生素。在沒有禁忌的情況下，可以選用大環內酯類藥物，比如紅霉素、克拉霉素或阿奇霉素，還可以選擇喹諾酮類藥物，比如左氧氟沙星。對于流感病毒導致的咳嗽、咳痰，則可以應用奧司他韋等抗病毒藥物，并且可適當應用鎮咳藥物。對久咳不愈的患者必要時可以使用可待因。 痰量較多較黏稠的時候，則可以應用一種祛痰劑，比如乙酰半胱氨酸、溴乙新、也可以霧化吸入乙酰半胱氨酸的霧化溶液。同時患者還需要注意保暖，多飲水、清淡飲食、避免吸煙、飲酒、避免進食辛辣、過甜、過咸的刺激性食物，并且避免接觸過敏原等。 咳嗽是一種反射性的防御動作，通過咳嗽可以清除呼吸道內分泌物或異物。痰液是氣管和支氣管分泌的或肺泡內的滲出，借助咳嗽可以將痰排出。因此這種存在較多痰液的時候不建議止咳。呼吸系統的感染是引起咳痰的常見病因，包括細菌、結核菌、真菌、病毒、支原體或寄生蟲感染。另外，異物、腫瘤、物理化學過敏等因素，也可以刺激氣管和支氣管引起咳嗽。