兒童腦炎初期癥狀與一般感染癥狀相似，稱為非特異性癥狀，有發燒、頭疼、精神稍微差一點，也許還有呼吸道癥狀或消化道癥狀。還可能有特異性癥狀，即神經系統癥狀，也可能有顱壓高的癥狀。小孩會有劇烈頭疼、噴射性嘔吐。嬰兒由于不會說頭疼，會表現為打頭、用頭撞墻，即頭疼的表現。還會有意識改變，可能精神比較差、嗜睡、甚至昏迷叫不醒，還可以出現抽搐。除了發燒、頭疼顱內壓增高的表現以外，還有其它表現，如可以出現休克、DIC。 對嬰兒來講，出現腦炎的癥狀不典型，甚至沒有發燒，可能只表現為精神不太好、吃奶少，或體溫不升。因為嬰兒抵抗力差，容易發生腦膜炎、腦炎。所以嬰兒如果有發燒、感染，應該及時檢查，有感染就有可能出現腦炎。