減肥藥有可能會導致月經失調，月經是由于體內雌、孕激素周期性變化形成。體內雌、孕激素都叫做甾體類激素，是性激素其中的兩種，是以膽固醇為原料來制造。在減肥的過程中，可能會由于過度的減肥，飲食中膽固醇的原料不夠，導致月經不調，雌、孕激素水平下降。同時雌、孕性激素經肝代謝，減肥藥會干擾脂代謝或者糖代謝，尤其會干擾脂代謝。有的人吃完減肥藥可能會有肝功能異常，說明干擾了肝功能的脂代謝。肝功可以滅活性激素，如果肝功異常也會導致月經雌、孕激素的代謝異常，也會導致月經不調。但是并不是所有的減肥藥，都有可能會有這種作用。