全飛秒手術過程是使用飛秒激光完成的，激光掃描的時間大概在28-29秒，整個手術的時間在10-15分鐘，需要患者完全配合醫生。如果術中配合的好，手術的成功率幾乎是100%。由于不需要制作角膜瓣，全飛秒術中沒有角膜瓣相關的術中并發癥。 全飛秒手術全程可控，即使出現了術中失負壓或者透鏡破裂的情況，經驗豐富的屈光手術醫生也能夠很好的處理，不會影響最終視力恢復以及視覺質量恢復。全飛秒手術術中的配合很重要，手術之前醫生也會和患者完全溝通，告訴患者術中應該怎樣配合。