大腦半球手術可能導致中樞的功能損害，出現相應的后遺癥，比如偏癱、失語、癲癇，或者視野缺損；如果丘腦或者下丘腦損傷，也可能導致病人昏迷。人體具有兩側大腦半球，對于右利手的人群來說，左側是優勢半球，優勢半球具有語言、書寫中樞。另外，雙側的大腦半球都具有運動、感覺、視力中樞，大腦半球深部的丘腦、下丘腦也是基本的生命中樞。隨著近年來我國神經外科的水平不斷提高，大腦半球的手術并發癥越來越低，大部分病人的神經功能都能得到良好的保護。