祛除扁平疣最為有效的方法是激光治療，然后依次為冷凍治療以及藥物治療，具體治療方法如下：1、激光治療：屬于治療扁平疣最為有效的方法，激光治療副作用最小，治療效果較為徹底，療效有效率可達95%以上，因此激光治療是較為有效、安全的治療方法。激光治療最常見的不良反應，是可能會在局部形成凹陷性瘢痕，取決于操作員的水平與皮疹大小。如皮疹較大，形成凹陷風險會較大，皮疹較小，發(fā)生凹陷的風險也就較小；2、冷凍治療：屬于物理治療，冷凍治療的風險在于比較容易造成局部色素沉著或色素脫失，這種脫失甚至可能為永久性脫失。因此如果皮疹位于面部，采用冷凍治療時可能會產(chǎn)生色素沉著，對面容造成損傷；3、藥物治療：治療效果比物理治療稍差，最高大概有80%的治愈率，可用外用藥物與口服藥物進行治療，通常選擇抑制角質增生的藥物，以及抗病毒的藥物進行治療。