眼睛周圍長扁平疣想要去除，可以采取冷凍激光的物理療法，也可以使用抗病毒藥物進行治療。扁平疣是由人乳頭瘤病毒感染所引起的常見病毒性皮膚病，好發于面部、手背等處，主要表現為局部有黃褐色或者淡黃色的扁平丘疹，人為搔抓后可以使其增多。針對扁平疣治療方法有很多，可以使用液氮冷凍，通過低溫將局部疣體組織破壞，可以去除扁平疣。另外，可以采取電離子灼燒或者二氧化碳激光，通過熱效應將局部扁平疣炭化、氣化，也可以治療扁平疣。但是，如果是眼睛周圍的扁平疣，在治療過程中就要注意加強眼睛防護，避免激光或者冷凍傷及眼睛，在黏膜部位引起不良反應。此外，可以使用藥物治療，比如抗病毒的干擾素、咪喹莫特霜、氟尿嘧啶軟膏都可以使用，有時還可以配合維A酸類的藥物，比如維A酸軟膏局部外用，也有一定的促進扁平疣消退的作用。有時可以把物理療法和藥物療法聯合起來使用，可能效果更好。