腎臟囊腫一般不會自行消退。通常認為腎囊腫是腎小管憩室長大而來，腎小管憩室在生長的過程中會與腎小管脫離，形成一個個獨立的囊泡，獨立囊泡具有分泌功能，所以會不斷長大，長大到一定程度可能對腎臟造成影響。通常認為腎囊腫>5cm時，可能對腎臟造成影響，影響局部腎臟功能。另外也有可能導致病人出現腎臟積水，甚至尿路結石、腎盂腎炎情況。如果腎囊腫長得較大，一般會評估是否需要進一步手術治療，手術治療可以將病人囊腫消失。如果沒有特殊治療，一般腎臟囊腫不會自行消失，只會逐漸長大，長到對病人有影響時選擇手術方式讓囊腫消退。可以穿刺抽囊液并打硬化劑，還可以采取去頂減壓術，或者囊腫切除術，使囊腫消除。